アマパの主な気候は、高温多湿の赤道直下で、高温と相対湿度が高くなります。冬と夏の 2 つの明確な季節があり、年間平均気温は 25 °C から 27 °C の間で変化します。降水量は多く、年間平均降水量は2,500mmです。
アマパのもう 1 つの重要な物理的側面は、植生に覆われていることです。高温多湿な気候のアマゾン森林は主要な生物群系であり、州領土の約 90% を占めています。サバンナ、野原、海岸のマングローブの地域も見られます。
アマパの水路網は非常に複雑で、アマゾン水路の一部であるいくつかの川によって形成されています。州を流れる主な川は、アマゾナス川、アプレマ川、アラグアリ川、ヤリ川、マラカ川、マタピ川、オイアポケ川、ペドレイラ川、ビラ ノヴァ川などです。